Действия «Black Prophecy» разворачиваются в 26-м веке. К этому времени человечество населяет всю галактику, но лишь немногие человеческие колонии находятся под управлением людей. Фактическими правителями являются биогенетическая раса Генидес и кибернетическая раса Тай. Обе эти расы стремятся к полному господству над всем человечеством, что толкает их на земли расы пришельцев, не терпящей все иные цивилизации. Раса носит название Реставраторы.

Для того, чтобы иметь шанс на успех в этом кровопролитном противостоянии, вам необходимо поддержать одну из двух рас, управляющих людьми.

Сюжет «Black Prophecy» создавался при непосредственном участии писателя-фантаста Майкла Маррака. Онлайн-вселенная этой игры позволит игрокам поучаствовать в массовых битвах и бесчисленных миссиях, строя тем самым новое будущее для человечества.